More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1966 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  85.56 
 
 		 270 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  88.1 
 
 		 270 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  82.53 
 
 		 270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  79.93 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  64.42 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.37 
 
 		 270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.78 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.46 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 		 267 aa  286  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  50.75 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.15 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  39.56 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 299 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  36.53 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.96 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.59 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.33 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.06 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.2 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>