More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1870 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  93.31 
 
 		 270 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  85.56 
 
 		 270 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  86.25 
 
 		 270 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  80.3 
 
 		 269 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.89 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 		 277 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 		 280 aa  301  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.85 
 
 		 270 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.77 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  56.83 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.46 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.37 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  49.63 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  40.22 
 
 		 356 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  40.75 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.77 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.45 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.68 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>