More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1678 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  86.25 
 
 		 270 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  85.56 
 
 		 270 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  82.53 
 
 		 270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  80.3 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  61.8 
 
 		 277 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  60.07 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.36 
 
 		 271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.26 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.67 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 268 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  58.36 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  58.36 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  54.61 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  54.68 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.72 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  40.43 
 
 		 356 aa  192  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.48 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.06 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.26 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  31.32 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>