More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4481 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  70.44 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  68.91 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.99 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.36 
 
 		 270 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  58.21 
 
 		 270 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  58.74 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  58.36 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 		 275 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  54.17 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  54.92 
 
 		 266 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.02 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.25 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.91 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 268 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  42.56 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  41.32 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  41.74 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  41.32 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.3 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 		 967 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.86 
 
 		 659 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  31.37 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.34 
 
 		 661 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  30.65 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.11 
 
 		 662 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.21 
 
 		 663 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>