More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1409 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  41.88 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.55 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0278  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.63 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  28.03 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.34 
 
 		 651 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3478  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.03 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0451778  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.16 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.75 
 
 		 659 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.54 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  29.5 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4022  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.07 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.2 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.42 
 
 		 662 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 291 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.71 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.15 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.78 
 
 		 662 aa  98.6  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4870  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.07 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00246591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  29.48 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0427  enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1802  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.28 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0629  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.28 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.57 
 
 		 661 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>