More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2926 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 269 aa  546  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  80.3 
 
 		 270 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  80.3 
 
 		 270 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  79.93 
 
 		 270 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  81.78 
 
 		 270 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  60.9 
 
 		 277 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.41 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  59.4 
 
 		 280 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.58 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.85 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  58.74 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  58.74 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.38 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  48.87 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  36.84 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.12 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.48 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.85 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.57 
 
 		 967 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.29 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.35 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.55 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>