More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0571 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
268 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
268 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
268 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
268 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
268 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
268 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 
268 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
268 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 
278 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
268 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
268 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  48.68 
 
 
269 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  48.11 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  46.1 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  45.27 
 
 
275 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 
266 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  39.71 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
270 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.39 
 
 
263 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
266 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
268 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
280 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 
270 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
271 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
269 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
275 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
270 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
277 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
270 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
269 aa  166  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
265 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
266 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 
261 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.87 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.97 
 
 
260 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
245 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.96 
 
 
258 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.92 
 
 
659 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.69 
 
 
268 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.29 
 
 
259 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 
277 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.45 
 
 
284 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.14 
 
 
269 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
265 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 
254 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 
262 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
258 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
256 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
257 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
254 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
265 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
262 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
263 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.56 
 
 
260 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
253 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
251 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
276 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.34 
 
 
261 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.65 
 
 
967 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
273 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
259 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
261 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
259 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
263 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
263 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
264 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
250 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
260 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
259 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
264 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
261 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
259 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 
265 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  28.09 
 
 
264 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>