More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4327 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  70.86 
 
 
278 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  65.93 
 
 
268 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
268 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
268 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  65.2 
 
 
268 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  65.93 
 
 
268 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  64.47 
 
 
268 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  63 
 
 
268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  62.27 
 
 
268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  65.2 
 
 
268 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
268 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
268 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  60.81 
 
 
269 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
268 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.97 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
266 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
266 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
270 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
275 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
275 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
270 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 
280 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
269 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.84 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
271 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
277 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  43.9 
 
 
265 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 
273 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 
273 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
267 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
259 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 
267 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
269 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.35 
 
 
260 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  28.81 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.81 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
263 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 
260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.16 
 
 
258 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
270 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 
265 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
267 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.57 
 
 
260 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
272 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
254 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
260 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
273 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.86 
 
 
264 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
263 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
261 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
260 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
273 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 
261 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
262 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
259 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
265 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
267 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 
278 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
271 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2497  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
255 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 
259 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
654 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.3 
 
 
254 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
266 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
268 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
259 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 
262 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 
258 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
260 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
260 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
267 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
260 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
260 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
259 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14230  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  26.04 
 
 
276 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.31 
 
 
251 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>