More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3457 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  99.25 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  98.13 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  90.3 
 
 		 268 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  82.84 
 
 		 268 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 		 268 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 		 268 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 		 268 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  65.2 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  64.18 
 
 		 268 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  65.67 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  63.3 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  41.7 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 270 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.45 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.92 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.65 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.41 
 
 		 662 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.3 
 
 		 651 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.64 
 
 		 662 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.07 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.22 
 
 		 659 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.53 
 
 		 663 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.44 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.84 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.39 
 
 		 967 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.06 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.93 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  30.7 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.95 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.94 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  33.94 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  28.62 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  33.94 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  33.94 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>