More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0573 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  99.25 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  98.13 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  90.3 
 
 		 268 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  83.21 
 
 		 268 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  84.33 
 
 		 268 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 268 aa  380  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  66.79 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 		 268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 		 269 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 278 aa  348  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.07 
 
 		 356 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.45 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.3 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.67 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.87 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.26 
 
 		 651 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.64 
 
 		 659 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.52 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.98 
 
 		 663 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.31 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.72 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.89 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.33 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  30.27 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.84 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.06 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.39 
 
 		 967 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.42 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.19 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.95 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.27 
 
 		 662 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.88 
 
 		 661 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>