More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0454 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  67.16 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  67.54 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  66.79 
 
 		 268 aa  361  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  67.91 
 
 		 268 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 		 268 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  65.67 
 
 		 268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  65.67 
 
 		 268 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 		 268 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  66.16 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  61.51 
 
 		 278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  64.93 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  60.81 
 
 		 299 aa  334  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 		 268 aa  329  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  48.86 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  45.95 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  42.98 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  29.86 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.14 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.79 
 
 		 662 aa  109  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.8 
 
 		 662 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.83 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.88 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.38 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.83 
 
 		 661 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.39 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.17 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.27 
 
 		 662 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  26.91 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.95 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  33.52 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.54 
 
 		 659 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.24 
 
 		 663 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>