More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3304 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  83.21 
 
 
268 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  82.84 
 
 
268 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  82.84 
 
 
268 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  81.34 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  82.84 
 
 
268 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  83.21 
 
 
268 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 
268 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  83.21 
 
 
268 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 
268 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 
268 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  65.93 
 
 
299 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 
268 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  63.31 
 
 
278 aa  357  9e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  67.54 
 
 
269 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 
268 aa  333  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  43.59 
 
 
356 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
270 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40.66 
 
 
268 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
266 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
266 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
270 aa  185  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 
270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
280 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
275 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
277 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
269 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
263 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
265 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
269 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
267 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
287 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
265 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
258 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
264 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.31 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
269 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
259 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  31.22 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 
254 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.08 
 
 
663 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.51 
 
 
265 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.63 
 
 
270 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
270 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 
260 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 
283 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
262 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.63 
 
 
659 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
260 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
280 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.54 
 
 
261 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.48 
 
 
260 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.21 
 
 
258 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.87 
 
 
260 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
264 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
270 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
270 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
280 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 
252 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
260 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
262 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.62 
 
 
662 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
260 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4870  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.92 
 
 
277 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
261 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 
283 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.86 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.57 
 
 
651 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.66 
 
 
967 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 
263 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 
267 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
259 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
260 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  25.97 
 
 
261 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
263 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>