More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2168 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
284 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.3 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  59.19 
 
 
279 aa  343  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.06 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.23 
 
 
286 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.56 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
270 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  48.34 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  48.34 
 
 
270 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.97 
 
 
270 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  48.71 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  48.34 
 
 
280 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  47.97 
 
 
280 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  45.76 
 
 
270 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  46.86 
 
 
270 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
270 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  49.08 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
277 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.29 
 
 
283 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.89 
 
 
967 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 
273 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.01 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.26 
 
 
280 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  43.17 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
271 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
271 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
271 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.63 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
274 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
273 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
274 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  35.51 
 
 
291 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
281 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 
287 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  35.19 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  39.01 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.99 
 
 
659 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
247 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  29.56 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.26 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  31.11 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.49 
 
 
260 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  31.14 
 
 
261 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
260 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
297 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  30.4 
 
 
297 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  31.11 
 
 
261 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
260 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
258 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
260 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
297 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.17 
 
 
260 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  30.4 
 
 
261 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.25 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
259 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
265 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.3 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
253 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  31.11 
 
 
261 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
259 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.62 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.25 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
269 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 
269 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 
258 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
257 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  27.68 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.95 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.15 
 
 
663 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  27 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.85 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  26.52 
 
 
663 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.09 
 
 
657 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>