More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0249 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
286 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.23 
 
 
284 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  53.96 
 
 
279 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.91 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.31 
 
 
277 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 
284 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.07 
 
 
276 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
286 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.27 
 
 
280 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
270 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  47.23 
 
 
280 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.36 
 
 
283 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  46.86 
 
 
280 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.65 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
270 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  43.17 
 
 
270 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
270 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  43.91 
 
 
270 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
270 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  43.01 
 
 
270 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
270 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
273 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.44 
 
 
967 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
274 aa  201  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  35.94 
 
 
280 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  40.07 
 
 
287 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
271 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
271 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
271 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
274 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  37.64 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
281 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
273 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
274 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  36.3 
 
 
278 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  38.74 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.85 
 
 
659 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
260 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
262 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
258 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
260 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
258 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
259 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
270 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.07 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  31.48 
 
 
270 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
261 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 
280 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
267 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
266 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.09 
 
 
662 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.32 
 
 
661 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  29.43 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.89 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.84 
 
 
662 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  28.47 
 
 
258 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
262 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
262 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  37.72 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.04 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 
271 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
271 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.62 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.72 
 
 
256 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
262 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
277 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.04 
 
 
662 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.62 
 
 
270 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>