More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4829 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  61.89 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  60.37 
 
 		 270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 		 270 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  58.58 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  61.36 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  61.36 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  59.26 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  57.52 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.46 
 
 		 275 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  56.02 
 
 		 267 aa  271  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.61 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.79 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  52.83 
 
 		 268 aa  255  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.37 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  51.11 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.65 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  44.32 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.33 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.45 
 
 		 967 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.11 
 
 		 659 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.83 
 
 		 661 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.71 
 
 		 662 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>