More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3135 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 		 268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  64.18 
 
 		 268 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  63.81 
 
 		 268 aa  348  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  63.06 
 
 		 268 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  63.5 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  62.31 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 		 268 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 		 268 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  48.11 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.64 
 
 		 356 aa  195  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  42.56 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  42.56 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  37.17 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.51 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.19 
 
 		 659 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.26 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  36.53 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.82 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.91 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.82 
 
 		 662 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.23 
 
 		 662 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.13 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  35.47 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.47 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>