More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3709 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  544  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 
268 aa  380  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 
268 aa  380  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 
268 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 
268 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  67.16 
 
 
268 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 
268 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 
268 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  63 
 
 
299 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  65.3 
 
 
268 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  64.18 
 
 
268 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  67.91 
 
 
269 aa  348  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 
268 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  64.93 
 
 
268 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  60.43 
 
 
278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
268 aa  328  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
273 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  42.31 
 
 
356 aa  198  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
270 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.39 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  40.75 
 
 
270 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
269 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
266 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
270 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
270 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
273 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
273 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.88 
 
 
263 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
275 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
271 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
280 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
265 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
267 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
269 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.04 
 
 
259 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.17 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
260 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
263 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
263 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
254 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
260 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 
262 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 
265 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
269 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.84 
 
 
254 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 
254 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
270 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 
267 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1669  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.32 
 
 
284 aa  98.6  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.777037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.81 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  26.15 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.43 
 
 
967 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.84 
 
 
651 aa  96.3  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4901  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.26 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226502  normal  0.462899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  31.96 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1132  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.46 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.28 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.44 
 
 
663 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.3 
 
 
662 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.32 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.52 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  28.62 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  27.97 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.65 
 
 
258 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0278  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.6 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1705  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.68 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.84 
 
 
662 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
278 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>