More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0388 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  65.02 
 
 
270 aa  362  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  63.88 
 
 
270 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
273 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
268 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
268 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
268 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
268 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
299 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  40.44 
 
 
356 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
268 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
268 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
270 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
268 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
268 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
268 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
270 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
271 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.95 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
270 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
270 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
269 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
275 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
273 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
273 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 
266 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 
268 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
277 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
265 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 
274 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
245 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.75 
 
 
270 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
264 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
263 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 
261 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.38 
 
 
264 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.54 
 
 
281 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.09 
 
 
659 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
286 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
266 aa  119  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 
270 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
280 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
260 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
270 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
266 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
259 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  31.65 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.92 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  30.87 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
253 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.83 
 
 
967 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.52 
 
 
260 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  29.21 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
261 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
256 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
260 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.81 
 
 
661 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.84 
 
 
662 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04626  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.73 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
263 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
264 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>