More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1758 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.63 
 
 
267 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  74.51 
 
 
268 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.88 
 
 
260 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
270 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.19 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
260 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
287 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
263 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
265 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
267 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
259 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
269 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
264 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
273 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
264 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  36.43 
 
 
261 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 
265 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
265 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 
267 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
263 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
264 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.78 
 
 
263 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
267 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
264 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
266 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.11 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
262 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
264 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
266 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
257 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
271 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
260 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
267 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.16 
 
 
262 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
268 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
260 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
260 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
262 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
270 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.17 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
266 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.91 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
257 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.11 
 
 
659 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
269 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
264 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
260 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
261 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
290 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
264 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
275 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
280 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
260 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
260 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
260 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
256 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.75 
 
 
260 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
262 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
271 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
261 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
261 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
263 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.15 
 
 
260 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
260 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.88 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>