More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1594 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.03 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.1 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.36 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8352  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.01 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.65 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.37 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>