More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2240 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
272 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
259 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
276 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  47.29 
 
 
259 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 
266 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
259 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
259 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  55.68 
 
 
269 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 
273 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  49.59 
 
 
262 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  54.47 
 
 
263 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  54.25 
 
 
263 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  54.25 
 
 
263 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  51.42 
 
 
355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
259 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  54.88 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 
263 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 
262 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
263 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
262 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
259 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  48.63 
 
 
259 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
263 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.87 
 
 
255 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
263 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 
263 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
259 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
261 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
263 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 
259 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
257 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
262 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
267 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
280 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
266 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
257 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.49 
 
 
264 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 
266 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
260 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
276 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
262 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
260 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
267 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.57 
 
 
261 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
259 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
265 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
261 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
262 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 
263 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
262 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
261 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
266 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
284 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
256 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  35.54 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
256 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.95 
 
 
257 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.11 
 
 
262 aa  131  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
262 aa  131  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>