More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3447 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  497  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.47 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
262 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
257 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
270 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
259 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
259 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
259 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
259 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
262 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
261 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
259 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
266 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
264 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.24 
 
 
261 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
260 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
260 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
270 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.8 
 
 
271 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
262 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
264 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
256 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
262 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
262 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
255 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
266 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
263 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
259 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
276 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
263 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.2 
 
 
262 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
266 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
284 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
287 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
268 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
267 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
264 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.36 
 
 
263 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
264 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  42.97 
 
 
263 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
262 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
261 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
267 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
250 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
268 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
259 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
263 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
261 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
273 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
267 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
273 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
264 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
270 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
258 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
262 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
283 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
263 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
266 aa  148  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
266 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
259 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
262 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.45 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
260 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
263 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
267 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
275 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
259 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
261 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
266 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>