More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0348 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  95.56 
 
 
270 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  63.88 
 
 
275 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
268 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
268 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
268 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
268 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
268 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
299 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
269 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
268 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
268 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
266 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 
268 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 
268 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 
268 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  38.65 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
268 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
270 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
266 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
269 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
280 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
275 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
270 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
277 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
263 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
271 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
265 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
263 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
269 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.56 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
270 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
276 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
280 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 
267 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.65 
 
 
967 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 
266 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  30.67 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
270 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.02 
 
 
659 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
260 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
270 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 
264 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
280 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.24 
 
 
281 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 
263 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
273 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  36.45 
 
 
254 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
254 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
258 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
264 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
262 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
258 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.81 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.33 
 
 
258 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.85 
 
 
256 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
260 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
264 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
270 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
259 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
257 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
261 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
253 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>