More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1370 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
291 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  64.86 
 
 
279 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.3 
 
 
284 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.69 
 
 
284 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.91 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.12 
 
 
276 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
270 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  49.45 
 
 
270 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  49.45 
 
 
270 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  46.84 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  48.72 
 
 
280 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 
280 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  48.35 
 
 
270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  46.47 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.06 
 
 
270 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  49.45 
 
 
270 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 
270 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.49 
 
 
277 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
273 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.32 
 
 
967 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.85 
 
 
283 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
286 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.54 
 
 
280 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  40.91 
 
 
280 aa  219  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
275 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
274 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
271 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
271 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
271 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
273 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
281 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
274 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  37.5 
 
 
278 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
287 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  31.52 
 
 
291 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  36.94 
 
 
253 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.84 
 
 
659 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
262 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
258 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.73 
 
 
663 aa  118  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.11 
 
 
662 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
262 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
262 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
260 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 
259 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
247 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
259 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.78 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.63 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.35 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.35 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.11 
 
 
662 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
260 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
260 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
261 aa  112  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.52 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.43 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  27.24 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.22 
 
 
661 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.36 
 
 
259 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
267 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  26.3 
 
 
657 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 
258 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.97 
 
 
267 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.59 
 
 
271 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  27.55 
 
 
258 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>