More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2691 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.45 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.91 
 
 
279 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.01 
 
 
276 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
284 aa  265  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.71 
 
 
284 aa  262  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.54 
 
 
283 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.89 
 
 
291 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.12 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.35 
 
 
280 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 
270 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.16 
 
 
270 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 
270 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 
280 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 
270 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  41.33 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  40.22 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.02 
 
 
967 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 
274 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  35.06 
 
 
280 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
274 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  40.59 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
281 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
274 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
287 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
273 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  33.21 
 
 
291 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  39.82 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.04 
 
 
662 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.51 
 
 
662 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
262 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 
259 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.78 
 
 
662 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
269 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
266 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
263 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.97 
 
 
663 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  29.63 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.39 
 
 
661 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.68 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 
263 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
262 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
264 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
264 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.74 
 
 
659 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
251 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.29 
 
 
270 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.29 
 
 
270 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  27.04 
 
 
663 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
270 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
273 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
263 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.31 
 
 
260 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
259 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
287 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.27 
 
 
264 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
262 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
266 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
263 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.27 
 
 
657 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.48 
 
 
262 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
259 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  29.78 
 
 
264 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.48 
 
 
258 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
260 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>