More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2114 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  76.4 
 
 
283 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  75.84 
 
 
283 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  75.84 
 
 
283 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.23 
 
 
269 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  77.15 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  76.03 
 
 
286 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  73.61 
 
 
283 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  76.03 
 
 
286 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  71.54 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  73.68 
 
 
284 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  74.07 
 
 
302 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  73.78 
 
 
284 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  71.32 
 
 
270 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  72.49 
 
 
285 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  74.53 
 
 
284 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  69.14 
 
 
272 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  76.03 
 
 
284 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  72.08 
 
 
272 aa  368  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  71.27 
 
 
270 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  68.46 
 
 
268 aa  362  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  70.3 
 
 
284 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  66.17 
 
 
278 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  68.16 
 
 
277 aa  345  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  70.34 
 
 
267 aa  334  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 
277 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
275 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
263 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
260 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
262 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
262 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 
255 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
263 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
263 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
263 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
270 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
273 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
273 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
261 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
263 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
265 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
265 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
256 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.92 
 
 
261 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
267 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
261 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
267 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
277 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
260 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
264 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.93 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
260 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
266 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
259 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
268 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
262 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
268 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.14 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
261 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
255 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
267 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.14 
 
 
260 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.24 
 
 
266 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>