More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3834 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  91.61 
 
 		 283 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 		 283 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  77.45 
 
 		 283 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  75.72 
 
 		 283 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  86.01 
 
 		 284 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.41 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.03 
 
 		 269 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  71.79 
 
 		 283 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  68.12 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  70.32 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  70.67 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  70.7 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  71.8 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  68.27 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  68.29 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  70.08 
 
 		 270 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  69.62 
 
 		 268 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  70.15 
 
 		 284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  68.94 
 
 		 272 aa  349  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  66.16 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.63 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.62 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.68 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 267 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.52 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.14 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 261 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.09 
 
 		 663 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2878  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.71 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>