More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3608 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  92.16 
 
 
268 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  88.43 
 
 
268 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  82.84 
 
 
268 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.44 
 
 
269 aa  355  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  61.74 
 
 
265 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  60.46 
 
 
264 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.61 
 
 
263 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.68 
 
 
262 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.7 
 
 
290 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  45.96 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 
265 aa  188  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
259 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
259 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.69 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
267 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
261 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
259 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
275 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
262 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
285 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
277 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
259 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
259 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
270 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
276 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
283 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
259 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
263 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
259 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
261 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
259 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
274 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
266 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
265 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
260 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
264 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.86 
 
 
659 aa  141  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
262 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
262 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
278 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
264 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
269 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
283 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
263 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
263 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
275 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4241  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
261 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
264 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  38.3 
 
 
243 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
296 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
271 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
263 aa  135  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.83 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
259 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
263 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
265 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
263 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.32 
 
 
663 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 
257 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
287 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>