More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
251 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.21 
 
 
249 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.253569  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
249 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
260 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3677  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
251 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.21 
 
 
659 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.28 
 
 
260 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
266 aa  151  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  40.33 
 
 
661 aa  151  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 
267 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.19 
 
 
260 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.94 
 
 
260 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.04 
 
 
662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.46 
 
 
662 aa  146  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
260 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
259 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 
262 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 
257 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
267 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
260 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
261 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.99 
 
 
260 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.28 
 
 
253 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
260 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.99 
 
 
260 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
260 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
259 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.36 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 
263 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
269 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
269 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.78 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 
251 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
255 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
257 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
260 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.98 
 
 
663 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
268 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.27 
 
 
257 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
277 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
257 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
257 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
258 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
267 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.12 
 
 
662 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.89 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 
258 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
270 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
263 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
257 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
262 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.61 
 
 
273 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  34.15 
 
 
260 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
265 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
260 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.7 
 
 
258 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  36.77 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.36 
 
 
254 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
268 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
268 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.04 
 
 
270 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
257 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
262 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
258 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.16 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>