More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3677 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3677  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
249 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.53 
 
 
251 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
268 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
259 aa  156  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
258 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
257 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2036  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
257 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
257 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
257 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
258 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
263 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
260 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
265 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
270 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
257 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.73 
 
 
260 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.73 
 
 
260 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
258 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
259 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
257 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
258 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  35.97 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
259 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
259 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
258 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
259 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.75 
 
 
659 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
258 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
258 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
258 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
257 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
258 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
261 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.17 
 
 
260 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
258 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.39 
 
 
277 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
259 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.56 
 
 
661 aa  135  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.15 
 
 
662 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
258 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
262 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
249 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  35.39 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
259 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
257 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
257 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>