More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3423 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.91 
 
 
269 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.05 
 
 
267 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.96 
 
 
268 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  49.07 
 
 
268 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.5 
 
 
267 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.37 
 
 
267 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.44 
 
 
250 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
255 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.6 
 
 
273 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.75 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.41 
 
 
186 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
265 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
267 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
271 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
313 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
294 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
263 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
265 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
266 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 
259 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
262 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
273 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
260 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
264 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
262 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.95 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
259 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
255 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
270 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54494  enoyl-coa hydratase  35.48 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.963819  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.76 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.88 
 
 
651 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.37 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
264 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
257 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
269 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
270 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
261 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
257 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4727  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.59 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>