More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5361 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.93 
 
 
269 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 
268 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.18 
 
 
186 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
268 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.61 
 
 
268 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.87 
 
 
267 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.72 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 
255 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.52 
 
 
267 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
250 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.83 
 
 
255 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.81 
 
 
280 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
264 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
267 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
274 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
270 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
267 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
269 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.78 
 
 
262 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
275 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
259 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
266 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
264 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
259 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
274 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
259 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
267 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.62 
 
 
260 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
262 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
269 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
270 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
291 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
266 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
266 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.83 
 
 
260 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
261 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
266 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.77 
 
 
662 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.15 
 
 
663 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
268 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
266 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
263 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.82 
 
 
651 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.85 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
259 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>