More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3723 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0672  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.42 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3300  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.03 
 
 
263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4727  enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.87 
 
 
268 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1305  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.03 
 
 
263 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0628711  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2077  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.54 
 
 
272 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158607  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.68 
 
 
271 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2181  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.15 
 
 
268 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1748  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.43 
 
 
273 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6669  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.26 
 
 
268 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.92 
 
 
268 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0609667  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
257 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.19 
 
 
650 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 
259 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
261 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
258 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.66 
 
 
657 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.29 
 
 
662 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
259 aa  135  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
264 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.45 
 
 
661 aa  135  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.76 
 
 
659 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
255 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.18 
 
 
651 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.65 
 
 
662 aa  132  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.66 
 
 
663 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  31.76 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.06 
 
 
662 aa  126  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
259 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.3 
 
 
657 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1034  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.33 
 
 
636 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 
258 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  34 
 
 
261 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
268 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.12 
 
 
663 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
258 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
257 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
262 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
267 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
267 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
266 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.19 
 
 
265 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
261 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
261 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  33.86 
 
 
261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
266 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  32.52 
 
 
289 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
258 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.93 
 
 
260 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>