More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1305 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1305  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0628711  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3300  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.82 
 
 
263 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4727  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.6 
 
 
268 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0672  enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.92 
 
 
265 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.56 
 
 
271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2077  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.71 
 
 
272 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158607  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.92 
 
 
268 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0609667  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1748  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.23 
 
 
273 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2181  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.16 
 
 
268 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6669  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.86 
 
 
268 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.03 
 
 
267 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
257 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
257 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.18 
 
 
661 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.37 
 
 
659 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.89 
 
 
650 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.74 
 
 
662 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
261 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.93 
 
 
662 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
257 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
258 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.56 
 
 
657 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.47 
 
 
663 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.4 
 
 
662 aa  132  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
265 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1034  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.29 
 
 
636 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.03 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.07 
 
 
654 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  32.29 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.53 
 
 
657 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.46 
 
 
651 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
257 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
257 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
255 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
265 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.33 
 
 
257 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.54 
 
 
663 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
262 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
268 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
260 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
262 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  31.2 
 
 
283 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
265 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
258 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 
258 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
263 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
260 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
251 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 
258 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
270 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 
259 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
264 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
260 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
262 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
269 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
265 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 
262 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
254 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
258 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>