More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5886 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1748  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.88 
 
 
273 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2077  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.13 
 
 
272 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158607  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2181  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.17 
 
 
268 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6669  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.12 
 
 
268 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3300  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.88 
 
 
263 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1305  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.56 
 
 
263 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0628711  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4727  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.68 
 
 
268 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  79.26 
 
 
268 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0609667  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0672  enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.11 
 
 
265 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.68 
 
 
267 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.52 
 
 
659 aa  161  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
259 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.1 
 
 
661 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.88 
 
 
662 aa  155  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
257 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.02 
 
 
650 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.73 
 
 
662 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
267 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
264 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
257 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
259 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.44 
 
 
662 aa  145  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
257 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1034  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.94 
 
 
636 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.3 
 
 
651 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
265 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
263 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
260 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.94 
 
 
657 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
267 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
259 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
262 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
260 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
257 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
263 aa  136  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
262 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
262 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
262 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.71 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
260 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.2 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.06 
 
 
663 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.58 
 
 
657 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
259 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
258 aa  131  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
257 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.89 
 
 
663 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
265 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
259 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.54 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>