More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1056 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  503  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  56.85 
 
 
260 aa  265  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
269 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.8 
 
 
250 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.93 
 
 
267 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
268 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 
268 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.99 
 
 
255 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.27 
 
 
186 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
260 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
265 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
260 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
265 aa  111  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
270 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
253 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
270 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
259 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.29 
 
 
280 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
260 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 
257 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
258 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
258 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
267 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
259 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
260 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
277 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
260 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
273 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
264 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
260 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
259 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
313 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 
267 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
268 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
264 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
270 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
270 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  29.18 
 
 
258 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
269 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
268 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
264 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
260 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
258 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
273 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
265 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
270 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
261 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
265 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
264 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
266 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.78 
 
 
258 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
262 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 
262 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
262 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
261 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
259 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.4 
 
 
663 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
267 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.43 
 
 
651 aa  99.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>