More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0054 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  550  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  66.28 
 
 		 272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  57.41 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  57.99 
 
 		 270 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  56.6 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.33 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.29 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.43 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.16 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 		 271 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  40.5 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.62 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.19 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.53 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>