More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0643 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
265 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.4 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
259 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  44.27 
 
 
659 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.52 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
266 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
265 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.22 
 
 
260 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
260 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 
267 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
271 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  43.31 
 
 
661 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.18 
 
 
663 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.23 
 
 
651 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
263 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  40.89 
 
 
662 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
268 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.58 
 
 
662 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
261 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
260 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
258 aa  175  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
270 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
259 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.03 
 
 
662 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.95 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
260 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.91 
 
 
260 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 
257 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
258 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
258 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
257 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 
257 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
262 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
262 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 
265 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
262 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
258 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
257 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
260 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
260 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
263 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
258 aa  168  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
263 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
261 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
260 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
259 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
266 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
260 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
267 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
258 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
257 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  38.1 
 
 
283 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
258 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
269 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 
260 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
262 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
260 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
257 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
259 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 
258 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>