More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3363 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3363  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  45.27 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  45.27 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1279  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.56 
 
 		 243 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2500  enoyl-CoA hydratase  41.42 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 463 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.69 
 
 		 659 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.47 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.27 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.69 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  27.31 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.15 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3494  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198139 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.88 
 
 		 662 aa  99  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.15 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.76 
 
 		 663 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.08 
 
 		 662 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.76 
 
 		 661 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.23 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>