More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2500 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2500  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
288 aa  563  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
243 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  44.54 
 
 
244 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  44.54 
 
 
244 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  44.54 
 
 
244 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 
244 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  43.28 
 
 
246 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3363  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 
244 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1279  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.44 
 
 
243 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
264 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
258 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
265 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
273 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
262 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
261 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
263 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.76 
 
 
659 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
463 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
269 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
263 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.6 
 
 
260 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
260 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
258 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
258 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
267 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  32.8 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
277 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.27 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
261 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
259 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
267 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
267 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
264 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.65 
 
 
662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
275 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.97 
 
 
657 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
260 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  31.7 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.92 
 
 
267 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
266 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
267 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
264 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.45 
 
 
268 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.98 
 
 
260 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
253 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
259 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.13 
 
 
260 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
257 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
270 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.06 
 
 
261 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
259 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
258 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.55 
 
 
250 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
269 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
261 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.23 
 
 
662 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
257 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  35.69 
 
 
261 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
265 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
254 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.66 
 
 
261 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1770  naphthoate synthase  35.6 
 
 
263 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
259 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
279 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>