More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1770 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1770  naphthoate synthase  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  71.1 
 
 
260 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  72.76 
 
 
267 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1033  naphthoate synthase  70.34 
 
 
260 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  70.34 
 
 
260 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  71.1 
 
 
260 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  69.2 
 
 
260 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.05 
 
 
258 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1186  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  69.2 
 
 
262 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4105  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.96 
 
 
260 aa  367  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.920357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  67.68 
 
 
260 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1429  naphthoate synthase  68.08 
 
 
267 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640248  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6400  naphthoate synthase  68.08 
 
 
267 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.64049  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  57.46 
 
 
271 aa  315  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  57.47 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  56.7 
 
 
272 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  55.68 
 
 
265 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  55.77 
 
 
272 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  54.96 
 
 
271 aa  286  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  54.58 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  53.67 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  53.28 
 
 
272 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  53.28 
 
 
272 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  54.2 
 
 
273 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  54.2 
 
 
273 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  51.14 
 
 
272 aa  278  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  51.14 
 
 
273 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  51.14 
 
 
273 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  51.85 
 
 
279 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  53.44 
 
 
273 aa  276  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  54.75 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  52.29 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  52.67 
 
 
273 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  51.94 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  52.51 
 
 
273 aa  270  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  51.91 
 
 
273 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3281  naphthoate synthase  50.77 
 
 
285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  53.36 
 
 
275 aa  268  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  50.77 
 
 
285 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  50.58 
 
 
285 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  50.58 
 
 
285 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  53.08 
 
 
276 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  50.58 
 
 
285 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02189  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1523  naphthoate synthase  52.67 
 
 
272 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  52.81 
 
 
277 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2558  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.20576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  50.77 
 
 
285 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2408  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  50.38 
 
 
285 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2417  naphthoate synthase  50.19 
 
 
285 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  50.77 
 
 
285 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02148  hypothetical protein  50.19 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  52.65 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  52.83 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  50.38 
 
 
285 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1616  naphthoate synthase  51.34 
 
 
274 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.796217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  52.08 
 
 
287 aa  263  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  50.97 
 
 
272 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  49.81 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  50 
 
 
280 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1559  naphthoate synthase  50.38 
 
 
296 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  50.57 
 
 
287 aa  262  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  53.56 
 
 
279 aa  262  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1101  naphthoate synthase  50.97 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  52.67 
 
 
277 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  50.19 
 
 
287 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004030  naphthoate synthase  49.81 
 
 
288 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2893  naphthoate synthase  50 
 
 
283 aa  260  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0874226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  51.52 
 
 
279 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  51.13 
 
 
299 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  49.08 
 
 
280 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  50.75 
 
 
297 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  52.83 
 
 
277 aa  258  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  52.45 
 
 
277 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  50.19 
 
 
279 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2930  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.41 
 
 
264 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  53.01 
 
 
277 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  51.15 
 
 
277 aa  256  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  50.19 
 
 
274 aa  257  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  50.37 
 
 
279 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  50.77 
 
 
273 aa  254  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  50 
 
 
297 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01431  naphthoate synthase  49.03 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>