More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2171 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
282 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
260 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
264 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
259 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.95 
 
 
263 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
264 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
264 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
263 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
262 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
258 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
263 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
270 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
256 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.22 
 
 
659 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
271 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
271 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.77 
 
 
270 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
265 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
255 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
266 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
270 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
262 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
270 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
266 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.75 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
262 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
270 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
259 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4241  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
261 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
267 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.48 
 
 
273 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 
259 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
261 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.17 
 
 
262 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
256 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
280 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.92 
 
 
663 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
259 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
267 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
257 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
258 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>