More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4005 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  78.64 
 
 
318 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  59.71 
 
 
298 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  60.07 
 
 
298 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  60.07 
 
 
298 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  58.25 
 
 
301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  56.9 
 
 
301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  48.58 
 
 
282 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  48.99 
 
 
282 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  48.18 
 
 
282 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  44.07 
 
 
281 aa  215  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.12 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
285 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.33 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 
278 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
263 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 
302 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
260 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
318 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
312 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
308 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
264 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
267 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 
298 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
269 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
299 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
272 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
297 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
273 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  34.32 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
273 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
264 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.04 
 
 
251 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
273 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 
276 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
260 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
260 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
259 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
262 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
259 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
659 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.79 
 
 
255 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
275 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
258 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
257 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
257 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
273 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
270 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.19 
 
 
260 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
259 aa  99  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
259 aa  99  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
259 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.89 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
262 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
258 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.76 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
258 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>