More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0566 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0567  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000057377  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
292 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
273 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  36.87 
 
 
258 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
257 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
257 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
259 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
280 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
257 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.45 
 
 
257 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
297 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.35 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.58 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
269 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
259 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 
258 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.53 
 
 
263 aa  116  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
260 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.54 
 
 
260 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
260 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.12 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.05 
 
 
259 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.6 
 
 
251 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
270 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
295 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
259 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 
260 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
259 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
259 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.66 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.55 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
260 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
256 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
258 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
267 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
258 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.92 
 
 
659 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
256 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
257 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
309 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
273 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
259 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
260 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.22 
 
 
661 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
281 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
281 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
269 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>