More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7065 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.89 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1244  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  0.046389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1906  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.73 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.25 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
260 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
259 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
258 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 
257 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.24 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 
258 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
260 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.62 
 
 
283 aa  122  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
269 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 
260 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
256 aa  121  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.27 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
258 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
280 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
248 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
259 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.05 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 
263 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
258 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
268 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 
257 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
257 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
267 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
257 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
257 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.88 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  28.17 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.89 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.72 
 
 
255 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
259 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.5 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.19 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0212  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.75 
 
 
250 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
259 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
259 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
257 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  28.98 
 
 
277 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.81 
 
 
260 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
259 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  27.95 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.93 
 
 
262 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.28 
 
 
259 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  27.88 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>