More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1906 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1906  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223556  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
253 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
256 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1244  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 
260 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  0.046389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 
268 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
263 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
257 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
257 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.09 
 
 
260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.25 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.69 
 
 
260 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.25 
 
 
255 aa  118  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
263 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
267 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
252 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
256 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
256 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
264 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
257 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
267 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
265 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
257 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
257 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.78 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.71 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
257 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
237 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
259 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.46 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
259 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 
253 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
258 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.07 
 
 
259 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
249 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 
265 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 
259 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
257 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  28.22 
 
 
261 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
254 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
275 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
261 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
259 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
262 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
258 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.57 
 
 
258 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>