More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3350 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.09 
 
 
273 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.93 
 
 
272 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
271 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
275 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
267 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 
272 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  39.5 
 
 
264 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
300 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
260 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
302 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
260 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
260 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
282 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
260 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
257 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
282 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
283 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.27 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
297 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.39 
 
 
259 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
258 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
258 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
300 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
302 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
263 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
248 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
259 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.85 
 
 
260 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
258 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
259 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.21 
 
 
260 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.39 
 
 
259 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
260 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
259 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
300 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
278 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0567  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000057377  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.64 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.56 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
259 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
260 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
260 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
269 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  34.43 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
304 aa  118  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.84 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
263 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
257 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
257 aa  116  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
259 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
260 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
266 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.67 
 
 
663 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  34.24 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.45 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.5 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>