More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1028 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
273 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
302 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
267 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
275 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
282 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 
312 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
309 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
292 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
283 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
318 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
287 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
269 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
285 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  29.86 
 
 
312 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  29.86 
 
 
312 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 
312 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
312 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
260 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 
264 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
258 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
301 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
257 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
260 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.91 
 
 
257 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
257 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
259 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
257 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
258 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
318 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
298 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
266 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
263 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
260 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
260 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
260 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
277 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
308 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 
262 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
264 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>