More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1431 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  95.04 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  93.26 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  53.41 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  53.96 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.67 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.49 
 
 		 300 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.05 
 
 		 285 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.11 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 		 297 aa  244  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  47.19 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  48.57 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  48.57 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  48.99 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  49.38 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  41.79 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.98 
 
 		 662 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.72 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.07 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.55 
 
 		 659 aa  125  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35 
 
 		 662 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  36.52 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.85 
 
 		 661 aa  122  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.64 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.91 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.27 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.01 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.58 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.35 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.26 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>