More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2067 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
278 aa  563  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  63.3 
 
 
260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  62.92 
 
 
260 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  62.92 
 
 
260 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  62.31 
 
 
260 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  60.74 
 
 
263 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  62.88 
 
 
264 aa  304  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  57.88 
 
 
302 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 
269 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
295 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
282 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  48.9 
 
 
281 aa  235  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 
283 aa  234  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
282 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 
282 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
308 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
300 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.06 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 
285 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  48.79 
 
 
281 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  44.18 
 
 
318 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  47.74 
 
 
298 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
267 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
318 aa  208  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  45.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  45.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
301 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
298 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 
301 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 
302 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
272 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
299 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  38.16 
 
 
261 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
259 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
255 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
264 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
271 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
270 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
280 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
259 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.59 
 
 
659 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
259 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
261 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2930  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
264 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
256 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
287 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
259 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
276 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
263 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
262 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
258 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
259 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
273 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  34.72 
 
 
280 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
262 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  35.41 
 
 
274 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.89 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.08 
 
 
662 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>